毛細管色譜柱具有以下優點

　　（1）分離效率高。比填充柱高10～100倍； 總柱效高：盡管毛細管柱效比填充柱大，但仍處于同一數量級。然而毛細管柱為開管 柱，可以做得更長（n大）。此外，柱管中心是空的，因此渦流擴散項不存在（A=0）， 譜帶展寬小 因而總柱效高 譜帶展寬小，因而總柱效高。

　　（2）分析速度快。用毛細管色譜分析比用填充柱色譜速度,相比率（Vm/Vs）大，分配快， 有利于提高柱效；加上保留因子k小，滲透性好，因而分析速度快； 有利于提高柱效；加上保留因子k小，滲透性好，因而分析速度快；

　　（3）柱容量小。進樣量小（對單個組分而言，約0.5 ug 即達極限），需采用分流技術并 使用更高靈敏度的檢測器；這是毛細管柱zui大的不足，尤其對痕量分析來說極為不利， 而且寬沸程的樣品在分流后會失真。

　　（4）色譜峰窄、峰形對稱。較多采用程序升溫方式。

　　（5）靈敏度高。一般采用氫焰檢測器。